Liste (non exhaustive) de quelques requêtes R et PMSI MCO qui seront présentées lors de la formation « R et PMSI MCO » qui aura lieu à Paris les 8 et 9 octobre 2020., essentiellement lors des ateliers « Traitement de données PMSI MCO et associées en R » (8 octobre 2020) et « Bibliothèque requêtes PMSI MCO en R » (9 octobre 2020)

Le code R de chacune de ces requêtes sera fourni dans le support de la formation et dans la correction des exercices. Les résultats de certaines de ces requêtes seront illustrés graphiquement dans l’atelier « Les graphiques en R ».

Les référentiels PMSI et tiers utilisés pour ces exercices seront fournis en début de formation.

A l’issue de la formation, les participants seront autonomes pour coder et personnaliser ces familles de requêtes avec leurs données, en toute indépendance par rapport à leur service informatique ou à un logiciel commercial.

# nb RUM et des séjours par filtre (GHM, regroupement de GHM, présence d’au moins 1 codage CIM-10 ou CCAM, …)
# répartition des séjours multi-rum par nb de RUM
# nb d’UM différents avec au moins 1 séjour groupé dans une CM ou un regroupement de GHM
# proportion de séjours de sévérité 3 et 4
# taux de décès
# calcul des IP-DMS
# activité par UM/regroupement UM (service, pôle, regroupement libre) = DMS, nb RUM, nb séjour, valorisation T2A, nb patients
# séjours en provenance des urgences par UM/regroupement d’UM
# séjour 0, 1 ou 2 journée(s) en HC (séjours dits « forains »)
# codage médical par position (DP,DR,DAS) par pathologie. Tri par occurence.
# case mix des codages CIM-10 par position (DP,DR,DAS)
# nb accouchement dans l’établissement
# répartition des accouchements par classe d’âge
# nb accouchements par voie basse spontanée / assistée / instrumentale / césarienne programmée / césarienne en urgence ou pendant le travail
# taux d’accouchement avec péridurale / épisiotomie
# activité de réa
# proportion des séjours avec passage en réa dans le 1er RUM par rapport au total des séjours avec passage en  réa
# repérage des séjours avec passage en  réa dans le dernier RUM pour les séjours multi-RUM
# regroupement des UM en services et en pôles
# produire un case mix (exemples : case mix des GHM, des GHS, des DA)
# case mix des DMI posés pour les séjours de chirurgie orthopédique (exemple de requêtes joignant 2 sources de données PMSI)
# case mix des UCD dispensés pour une sélection de séjour
# sélection de séjours via la présence ou l’exclusion d’une liste d’actes CCAM ou de codes CIM-10 ou de classification GHM
# analyse d’activité par phénotype (exemple d’import en R d’un référentiel externe structuré)
# calcul du score de Charlson (exemple de recours à un package métier)
# cohérence du codage des unités typées avec les pathologies de ces unités
# repérage des séjours substituables (exemple de codage en R d’un algorithme simple)
# suivi de l’activité de chirurgie ambulatoire
# ré-hospitalisation à 7 jours et 30 jours des séjours de chirurgie ambulatoire
# régressions linéaires simples (valorisation T2A par durée de séjour)
# suivi d’activité pluriannuel avec comparaison inter-annuelle
# identification des séjours longs par différentes approches (dépassement d’un nombre fixe de journées ou d’un coefficient par rapport à la DMS nationale du GHM du séjour ou par rapport à la DMS du GHM dans l’établissement, dépassement de la BH, durées statistiquement aberrantes (outliers))
# test-t de Student (exemple : comparaison de DMS pour 2 échantillons de séjours différentiés par un codage)
# test du khi-2 (exemple : indépendance du mode de sortie par classe d’âge pour une prise en charge donnée)
# activité de cancer Chirurgie Digestive (exemple de codage d’un algorithme INCa)
# case mix GHS de l’activité avec DM intraGHS (exemple de jointure avec un référentiel tiers : la liste des DM intraGHS)

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