Jeudi 8 mars et vendredi 9 octobre 2020 à PARIS
De 9h00 à 17h30
Avec son partenaire FormaTIM, organisme de formation PMSI référencé Datadock, Datamis organise le jeudi 8 mars et le vendredi 9 octobre 2020 deux journées exclusives de formation consacrées à l’utilisation de R, langage open source de traitement et d’analyse de données, pour l’analyse du PMSI MCO.
Liste de questions/réponses sur la formation.
Programme – Contenu de la formation
Programme Journée 1 (jeudi 8 octobre 2020)
Atelier « Les bases de R »
L’environnement RStudio
Introduction élémentaire à R
Les packages en R
Le package dplyr
Les types de données : numérique, caractère, catégorielle
Les formats de données : vecteurs, listes, data.frame, data.table, tibble
Gestion des fichiers et des projets en R
Exemples d’analyses PMSI MCO élémentaires en R
Atelier « Traitement de données PMSI MCO et associées en R »
Importation des fichiers PMSI MCO standardisés (rss, vid-hosp, fichcomp,rsf-ace, rsf, fichsup) en data.frame
Importation de fichiers tiers : référentiels PMSI (CIM-10, CCAM, LPP, UCD), fichiers propres à l’établissement (fichiers des chirurgiens par séjour, fichiers horaires ACE, intitulés des UM, ….)
Gestion des données liées au PMSI MCO en R : « nettoyage » de données, association de jeux de données, sélection
Export de données à partir de R
Performance des requêtes en R
Atelier « Les graphiques en R »
Présentation du package ggplot2 : grammaire, thèmes, axes, types de graphiques, annotations, vignettes
Data visualisation du PMSI MCO
Histogrammes, diagrammes circulaires, boîtes à moustache, nuages de points, lignes
Exemples de graphiques PMSI MCO standards
Exemples de graphiques PMSI MCO évolués
Programme Journée 2 (vendredi 9 octobre 2020)
Atelier « Programmer en R »
Programmer des fonctions dans R
Les fonctions statistiques utiles en PMSI MCO
Bonnes pratiques de programmation
Exemples de fonctions d’analyses PMSI MCO en R
Atelier « Bibliothèque requêtes PMSI MCO en R »
Requêtes OVALIDE
Repérage de séjours potentiellement sous-évalués en T2A
Repérage d’atypies de codage : CIM-10 (DP, DR, DAS), CCAM, durées de séjour, classification GHM-GHS, suppléments, autorisation, cohérences médicalo-centrées
Requêtes spécifiques Chirurgie
Requêtes spécifiques Médecine
Requêtes spécifiques Obstétrique
Requêtes spécifiques ACE
Case mix d’activité
Exercices participatifs
Atelier « Rapport PMSI MCO dynamique »
Présentation du package R Markdown
Conception d’un rapport PMSI MCO élémentaire
Exemples de rapports PMSI MCO dynamiques
Atelier « Traitement des données nationales open source en R »
Présentation des contenus des bases nationales PMSI open source : ScanSanté, Open Damir, Open CCAM, Open Medic
Importation de ces données avec R
Utilisation de ces données en lien avec l’analyse d’activité PMSI MCO des établissements.
Personnes concernées
Médecins DIM ou MIM expérimentés
TIM ou faisant fonction de TIM expérimentés
Ingénieurs et statisticiens PMSI
Pré-requis
Maîtrise des règles du PMSI MCO
Pratique éprouvée de l’analyse du PMSI MCO
Aucune connaissance à priori de R n’est requise
Compétences visées
Manipuler des données PMSI et apparentées en R
Développer des requêtes d’analyses PMSI MCO en R
Développer des graphiques d’analyses PMSI MCO en R
Créer et maintenir un reporting automatisé PMSI MCO en R
Objectifs professionnels
Utiliser le langage R, les packages R et l’environnement de développement intégré RStudio pour l’analyse du PMSI MCO de son établissement
Formateurs
M. Denis GUSTIN
Ingénieur Grande Ecole, expert et formateur PMSI
Développeur R senior
Concepteur du logiciel PMSISoft, logiciel d’analyse, de requête et d’optimisation du PMSI et des recettes MCO
Concepteur du package refpmsi, package R de référentiels PMSI
Dr Pierre BALAYE
Médecin de Santé Publique, DIU SNDS, DEA Informatique, chef de Clinique en Informatique médicale et biostatistiques au CHU de Lille, consultant PMSI MCO, développeur et formateur R, spécialiste Tidyverse et R Markdown
Pédagogie
Exposés théoriques sous forme d’ateliers
Exercices à partir de jeux de données anonymisés
Mises en situation
Mise à disposition du support de cours et du cahier d’exercices avec les codes sources R
Informations pratiques
La journée de formation se déroulera de 9h00 à 17h30 à Paris, dans les locaux de l’ASIEM, 6 rue Albert de Lapparent 75007 PARIS
Accès
– Par métro : stations Duroc, Ségur, Sèvres-Lecourbe, Saint-François-Xavier, Ecole Militaire
– Bus : 82, 28, 92, 87
FormaTIM, organisme de formation enregistré sous le numéro d’activité : 93131666913 (Cet enregistrement ne vaut pas agrément de l’Etat).
Organisme référencé DATADOCK
Bulletin d’inscription
Pour vous inscrire :
- Télécharger le bulletin d’inscription
- Remplir et valider le bulletin d’inscription
- Renvoyer le bulletin d’inscription validé (1 bulletin par participant) à FormaTIM par fax au 09 72 34 90 57, par email à ssiaci@lespmsi.com ou par courrier à Datamis, 31 avenue de Ségur 75007 PARIS
Dès réception du bulletin d’inscription validé, nous vous confirmerons l’inscription du participant.
Pour tout renseignement, nous contacter.